對于在檢測特定零件的每一個探針和測頭的組合都要進行測頭標定，針頭應當用標準球或其他被認可的有證標準器來標定（見附圖），針頭及標準器在任何時候保持清潔，用戶應當采用面向任務的測量策略，也就是針頭尺寸的標定應當與測量工件時的條件相同，理想的來說，在標定測頭和檢測零件時探測方向和速度應當相同。
一般是用一個有合格證的標準球來進行標定，在標定時針頭在幾個平面內按垂直于標準球表面的方向運動，應用合適的方向來標定測頭可以明顯減少觸發測頭在3600 內預行程變化的影響。
細心的對探針的標定將改進某些測量的精度，例如特征的尺寸大小。
增加標定測頭時的測點數，有效針頭直徑將更精確。
較小的探針直徑推薦用較小的標準球，例如1 mm 直徑的針頭用8 mm 直徑的標準球標定。應當知道，用戶如果用了幾個標準球，那么在軟件中輸入的值和所用的標準球肯定有關。
常見的的錯誤是輸入了標準球的錯誤直徑，若這樣，以后探測的結果肯定不正確。
用戶應當保留測頭標定歷史的書面記錄，而且在標定標準球時與歷史的記錄相比較，下述的問題應當提出：測頭通常是輸出這個數嗎？假如不是，為什么此值會改變？
假如在三坐標測頭標定中值有明顯的變化，那么用戶應采取行動去調查原因，應當檢查探針及標準球的清潔狀況，用戶應當確認在軟件中輸入的標準球數值是他在用的球的，而探測的策略和歷史上的相同。
也可以用量塊及環規去標定測頭探針。
但標準球更好，因為它考慮了所有的探測方向。
